也是可以提起诉讼的。也就是说如果双方就商标著作权的法院管辖的问题有异议的是可以在规定的时间范围之内向上级人民法院提起诉讼申请的，要求变更审理的管辖法院，这是合理的行为。
一、商标著作权的法院管辖可以提起诉讼吗?
也是可以提起诉讼的。商标侵权即商标侵权行为，是指行为人未经商标权人许可，在相同或类似商品上使用与其注册商标相同或近似的商标，或者其他干涉、妨碍商标权人使用其注册商标，损害商标权人合法权益的其他行为。行为人销售明知或应知是假冒注册商标的商品，商标专用权被侵权的自然人或者法人在民事上有权要求侵权人停止侵害、消除影响、赔偿损失。
二、法院指定管辖权的法律规定内容是什么?
(1)有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权。
所谓特殊原因，包括事实上和法律上的原因。事实上的原因，如有管辖权的人民法院遇到了不可抗力的事由，即地震、水灾等无法行使管辖权;法律上的原因，如受诉法院的审判人员，因当事人申请回避或者审判人员自行回避，无法组成合议庭对案件进行审理。出现上述情况之一的，应由上级人民法院在其辖区内，指定其他适宜的人民法院管辖。
发生管辖权争议的两个人民法院因协商不成报请它们的共同上级人民法院指定管辖时，如双方为同属一个地、市辖区的基层人民法院，由该地、市的中级人民法院及时指定管辖。
(2)因管辖权发生争议，经双方协商未能解决争议。
所谓争议，包括相互推诿或者相互争夺。通常是因为法院之间辖区界限不明，或者对法律的规定理解不一致，也有因地方保护主义为其局部经济利益争先立案。不论属于哪种原因引起的争议，应由双方协商解决，协商不成时应报请它们的共同上级人民法院指定管辖。
(3)受移送的同级人民法院发现移送错误时，应当报请上级人民法院裁定指定管辖。
(4)上级人民作出指定管辖期间，审理中止。
如果双方就上边著作权的问题不能够达成一致意见的，只能通过向人民法院提起诉讼的方式去解决。但是如果双方其中的一方对于管辖的法院是有意义的，是需要在规定的时间内向上级的人民法院提起变更法院管辖的诉讼申请的。
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