农村拆迁纠纷应当区分不同的纠纷类型来处理，如果是行政机关与行政相对人之间的纠纷，此时可以通过双方当事人之间协商、行政复议以及行政诉讼的方式来处理；如果是行政相对人之间的拆迁款纠纷，此时可以通过协商、仲裁以及民事诉讼得到方式处理。
一、农村拆迁纠纷应该怎么办？
农村宅基地房屋拆迁纠纷要区分是和征收方的外部补偿纠纷，还是关于补偿款、安置房等内部分配纠纷。如果是和征收方的外部纠纷，可以通过谈判、申请协调、裁决、行政复议、行政诉讼等途径来解决，如果是内部分配纠纷，则主要通过协商解决，确实家庭里已经闹翻了，商量不到一起，可以诉讼到法院，请法院来判决。
农村房屋拆迁纠纠纷可以通过行政复议或者是行政诉讼等相关的方式来进行解决。
1、行政复议。
认为行政主体的具体行政行为侵犯了其合法权益，可以向行政复议机关提出复议申请，行政复议机关依法对该具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定的行政行为。
2、行政诉讼。
对于拆迁单位作出的赔偿标准或未依照法律规定进行补偿的，被拆迁人可以向法院提起诉讼。
3、征地补偿协调裁决。
对补偿标准有争议的，由县级以上地方人民政府协调;协调不成的，由批准征用土地的人民政府裁决，机制分为协调、裁决两个部分，协调是裁决的前置，未经协调的不能进入裁决。
二、房屋拆迁纠纷怎么起诉？
拆迁补偿安置协议订立后，被拆迁人或者房屋承租人在搬迁期限内拒绝搬迁的，拆迁人可以依法向仲裁委员会申请仲裁，也可以依法向人民法院起诉。关于向人民法院提起民事诉讼的问题当事人向人民法院提起民事诉讼有以下两种情形。
1、拆迁补偿安置协议订立后，被拆迁人或者房屋承租人在搬迁期限内拒绝搬迁的，搬迁期限届满后拆迁人可以依法向人民法院起诉。
2、拆迁人与被拆迁人达成协议后，且拆迁当事人之间没有达成仲裁协议的，一方或者双方当事人反悔的，另一方当事人可以向法院提起民事诉讼。关于向人民法院提起行政诉讼的问题一旦拆迁人与被拆迁人或者拆迁人、被拆迁人与房屋承租人达不成拆迁补偿安置协议，都应当经当事人申请，先由同级拆迁管理部门裁决。裁决应当自收到申请之日起30日内作出。
其实无论是行政机关与行政相对人之间的外部纠纷，还是行政相对人之间的内部补偿款纠纷，此时都是可以通过协商的方式来处理的，如果是外部纠纷的话，此时双方当事人之间协商之后可以签订相应的拆迁补偿协议，协商不成的可以通过行政复议或者是行政诉讼的方式处理。
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