问题解答：
店铺转让纠纷可以通过以下方式处理：
1、协商：指当事人约定互相让步，不经法院以终止争执或防止争执发生。
2、人民调解：在人民调解委员会的主持下达成调解协议。
3、民商事仲裁：双方当事人之间定有仲裁协议或仲裁条款的，可以去设区的市及以上仲裁委员会进行仲裁。
4、诉讼：诉讼途径就是指受害人或案件的其他当事人依法向人民法院起诉，维护自己的合法权益。诉讼途径包括刑事诉讼、民事诉讼和行政诉讼。
法律依据：
《民事诉讼法》第二条
中华人民共和国民事诉讼法的任务，是保护当事人行使诉讼权利，保证人民法院查明事实，分清是非，正确适用法律，及时审理民事案件，确认民事权利义务关系，制裁民事违法行为，保护当事人的合法权益，教育公民自觉遵守法律，维护社会秩序、经济秩序，保障社会主义建设事业顺利进行。
第九十六条
人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
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