认定传染病防治失职罪既遂后会被按照三年以下有期徒刑对此作出处罚，根据《刑法》第409条当中明确的规定，传染病防治的卫生部门工作人员严重不负责任，导致传染病传播的，情节严重，将按照上述标准处罚。
一、认定传染病防治失职罪既遂后会被怎样判刑?
在预防、控制突发传染病疫情等灾害期间，从事传染病防治的政府卫生行政部门的工作人员，或者在受政府卫生行政部门委托代表政府卫生行政部门行使职权的组织中从事公务的人员，或者虽未列入政府卫生行政部门人员编制但在政府卫生行政部门从事公务的人员，在代表政府卫生行政部门行使职权时，严重不负责任，导致传染病传播或者流行，情节严重的，依照《刑法》第四百零九条的规定，以传染病防治失职罪定罪处罚，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役。
《刑法》第409条规定
“从事传染病防治的政府卫生行政部门的工作人员严重不负责任，导致传染病传播或者流行，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役。”
二、传染病防治失职罪构成要件是什么?
本罪侵犯的客体是国家对传染病防治的管理制度。
本罪在客观方而表现为从事传染病研治工作的政府卫生行政部门工作人员严重不负责任，导致传染病传播或者流行，情节严重的行为。
严重不负责任，是指从事传染病防治的政府卫生行政部门工作人员不履行法律和其职务要求的防治传染病的职责或者在履行职务中敷衍塞责、草率应付，极端不负责任，没有切实履行起应当履行、能够履行的义务。其具体表现形式是多种多样的，如，发现重大疫情应当报告而不报告或不立即报告;发现有传染病传播或流行的可能，应当采取措施而不采取措施;对传染病病人应当采取隔离治疗措施而未采取措施;应当对传染病的预防、治疗、监测、控制和疫情的管理措施进行监督、检查而不作监督、检查或者虽作监督、检查却不认真负责;发现有关单位与个人不符合传染病防治法的规定，应当责令其改进而不责令改进或者责令改进但不作检查或不作认真的检查;等等。
本罪的主体为特殊主体，即从事传染病防治的政府卫生行政部门工作人员。
从事传染病防治的政府卫生行政部门工作人员，是指各级政府行政主管部门主管传染病防治工作的人员。各级政府领导传染病防治工作、制定传染病防治计划并组织实施。具体职责是：组织开展预防传染病的卫生健康教育;组织力量消灭病媒昆虫、动物等;有计划地建设改造公共卫生设施、创造改善公共卫生的条件;遇有传染病暴发、流行，要组织力量补救，决定紧急措施的实施等。
本罪在主观方面，只能由过失构成、故意不构成本罪。
也就是应当知道自己严重不负责任的行为，可能会导致传染病传播或者流行，但是他疏忽大意而没有预见，或者是虽然已经预见到可能会发生，但他凭借着自己的知识或者经验而轻信可以避免，以致发生了造成严重损失的危害结果。行为人主观上的过失是针对造成重大损失的结果而言，但并不排斥行为人对其严重不负责任行为则可能是故意的情形，如果行为人在主观上对于危害结果的发生不是出于过失，而是出于故意，不仅预见到，而且希望或者放任它的发生，那就不属于本罪的犯罪行为，而构成其他的故意犯罪。
在当代的中国，是存在专门的传染病防治的政府卫生行政部门，而这个部门的工作人员，肯定是需要恪尽职守，严格的履行自身的职责，该部门工作人员严重不负责任，导致传染病传播或者流行，情节严重的，将会对此按照《刑法》第409条当中的规定判处三年以下有期徒刑。
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