处理抵押房屋拆迁纠纷的方式包括协商、起诉等，不管是采取什么方式处理纠纷，都最好是先收集相关与拆迁纠纷有关的证据。根据规定，因国家建设需要，将已设定抵押权的房地产列入拆迁范围的，抵押人应当及时书面通知抵押权人。
一、如何处理抵押房屋拆迁纠纷?
1、处理抵押房屋拆迁纠纷的方式包括协商、起诉等。
在抵押房产被拆迁时，抵押权人可以要求债务人清偿债务，此时，因为主债务清偿，抵押合同也得以解除。借款人在抵押房产被拆迁后，仍然继续履行合同约定的还款义务，但是不同意适用拆迁所得补偿款偿还贷款，也不愿意签订新的抵押合同的，债权人应当及时宣布贷款提前到期，要求债务人提前还本付息。为了阻止借款人转移财产，在主张提前清偿的同时，采取相应的诉讼保全措施。
2、抵押房屋具有以下特点：
(1)所有权受到限制
房屋一经抵押，该房屋的所有人的权利就受到限制，突出表现在于处分权的限制。按照所有权制度，所有人对房屋拥有处分权，而抵押之后，就不得变更房屋的所有权，由此影响到拆迁活动中对房屋补偿安置权益，未经抵押权人同意被拆迁人不得擅自作出处分。
(2)抵押权依附于债权
由于抵押房屋的目的是确保债务清偿，该债务应当是合法存在的。如果该债务消失，而被拆迁人的房屋上的抵押义务也消失，抵押权人不得限制原抵押所有人的处分权。
(3)抵押权须依法设立
在民间借贷中，债权人要求债务人提供房屋抵押作为债的担保，经常是以双方立字为据，忽略了抵押登记制度的存在，因此产生抵押权利的瑕疵。在拆迁实践中常有合同约定的抵押房屋被拆除，补偿完毕后，债权人才得知消息，因而权利受损而产生纠纷的情况。
(4)抵押房屋的性质变化
长久以来，设立抵押权的房屋多为私房，而近年来，这种性质发生逆转，企业用房占抵押房屋中的比例越来越高，已经成为其主要部分，而企业效益下降的范围越来越广，一旦拆迁，就会出现补偿金是优先安排职工还是偿还债务的矛盾，论其法理之分，确有棘手之处。
二、被抵押的房屋拆迁，可以选择货币的方式获得补偿吗?
1、被抵押的房屋拆迁，可以选择货币的方式获得补偿。
如果抵押房屋拆迁，选用了货币补偿方式，应当先由抵押权人和抵押人协商重新设立抵押权或者先偿还债务，使抵押房屋原有的抵押权消失，被拆迁人方能向拆迁人领取补偿金;如果抵押人和抵押权人不能订立新的抵押协议或者不能清偿到期债务，拆迁人有权暂不支付拆迁补偿金。拆迁人和被拆迁人都有及时通知抵押权人的义务。有的地方则有具体规定，对没有在拆迁期限内与抵押权人重新设立抵押或者清偿原债务的，对其补偿款由拆迁人交公证机关或房屋拆迁管理部门提存或代保管。
对货币补偿的抵押房屋拆迁，需要做以上规定，是因为所得的赔偿金应属于抵押财产。根据这条规定，房屋抵押权因房屋被拆迁而消灭，其补偿作为抵押财产使抵押权人的合同权益得到保障。
2、抵押房屋拆迁采用产权调换方式的操作
如果被拆迁人在抵押房屋拆迁时，选用了产权调换方式，其补偿操作应注意以下两点：
(1)抵押人和抵押权人应当就产权调换后的房屋作为房屋抵押物而重新签订抵押合同。新的抵押合同必须依法成立并登记生效。否则，拆迁人不得与被拆迁人订立拆迁补偿安置协议，即使订立也因违反《民法典》的规定而无效。
(2)抵押权人与抵押人在拆迁期限内达不成新的抵押协议的，该房屋视为产权有争议的房屋，由拆迁人提出拆迁补偿安置方案，报房屋拆迁管理部门审核同意后实施拆迁。拆迁前，房屋拆迁管理部门应当组织拆迁人对被拆迁房屋作勘察记录，并由拆迁人向公证机关办理证据保全。
另外，抵押房屋拆除未达成新的抵押协议，一般情况下被拆迁人方面的原因居多，主要是对原抵押合同持有异议。对此，抵押权人应及时提起诉讼，避免债权落空。当然也有被拆迁人主动起诉，要求法院确认原抵押合同无效或撤销原抵押合同，维护自身合法权益。
即使是被抵押了的房屋，也是有可能会被拆迁的。对于此种情形，抵押双方可以重新设定抵押房地产，也可以依法清理债权债务，解除抵押合同。如果抵押人不依法清理债务，也不重新设定抵押房地产的，抵押权人可以向人民法院提起诉讼。
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