小规模纳税人不能开具13%的增值税发票，无论是增值税专用发票还是增值税普通发票小规模纳税人均不得开具13%税率的发票。增值税小规模纳税人只能开具3%或5%征收率的增值税普通发票或增值税专用发票。小规模纳税人开具增值税专用发票可以申请自行开具，也可以申请到税务机关代开。
增值税一般纳税人适用的是增值税税率。企业发生增值税应税行为或进口货物，分别适用13%、9%、6%和零税率，可以开具13%、9%、6%的增值税专用发票或增值税普通发票。按照税法规定，企业销售货物、劳务、有形动产租赁服务或进口货物，除适用增值税9%和6%税率之外的纳税项目，均适用13%的增值税税率，并开具税率为13%的增值税专用发票或普通发票。
增值税小规模纳税人适用的是征收率。增值税征收率分别为3%和5%，小规模纳税人企业只能开具3%或5%的增值税专用发票或普通发票，无法开具增值税税率为13%税率的增值税专用发票或普通发票。
应该说，一般纳税人企业向增值税纳税人身份为增值税小规模纳税人的企业索要13%的增值税专用发票是不合理的，是不合理的要求，因为小规模纳税人企业是无法开具13%税率的增值税专用发票的；而如果小规模纳税人企业，为购买方提供了13%税率的增值税专用发票是违规违法的，是虚开增值税发票的行为，对购销双方来讲风险很大。
小规模纳税人一般只能开具增值税普通发票，不可以开具增值税专用发票。而现实中，如果小规模纳税人向一般纳税人销售货物或提供应税劳务，购货方要求销货方提供增值税专用发票时，小规模纳税人企业可以自愿使用增值税发票系统自行开具，或申请税务机关可以为其代开增值税专用发票。
选择自行开具增值税专用发票的小规模纳税人，税务机关不再为企业代开增值税专用发票。小规模纳税人无论是自行开具还是申请税务机关代开增值税专用发票，只能开具的是3%或5%征收率的增值税专用发票。
增值税小规模纳税人开具的增值税专用发票的销售额需要计算缴纳增值税应纳税额，并在规定的纳税申报期内向主管税务机关申报缴纳。在填写增值税纳税申报表时，应当将当期开具增值税专用发票的销售额，按照3%和5%的征收率，分别填写在《增值税纳税申报表》（小规模纳税人适用）第2栏和第5栏“税务机关代开增值税专用发票不含税销售额”的“本期数”相应栏次中。
需要强调的是，增值税小规模纳税人开具增值税专用发票的销售额，不享受免征增值税的优惠政策（月销售额低于15万元，季度销售额低于45万元免征增值税）。
总之，增值税小规模纳税人不能开具税率为13%的增值税专用发票或普通发票。小规模纳税人只能开具征收率3%或5%的发票，且一般为增值税普通发票，如果购买方需要开具增值税专用发票，销货方可以自行开具或到税务机关代开。小规模纳税人开具增值税专用发票需要计算缴纳增值税应纳税额，并按期申报，其开具增值税专用发票的销售额不享受免税政策。
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