专利诉讼程序阶段有：原告的准备工作、原告代理人的准备工作、被告和被告代理人的准备工作、开庭审判。专利诉讼是指有关专利权争议的诉讼，或者说不认可某些代理机构的说法而向法院请求诉讼的过程。
1、原告方代理人的准备工作
(1)审核委托人的资格
根据《专利法》第60条的规定，对于专利侵权行为，专利权人或利害关系人可以向人民法院起诉。
专利权人是指依法获得专利权的个人、法人或者其他民事主体。
利害关系人是指除专利权人外，专利权被侵犯时对其有利害关系的人，即专利实施的被许可人。
独占实施许可合同的被许可人可以单独提出专利侵权诉讼;排他实施许可合同的被许可人在专利权人不起诉的情况下可以单独提出专利侵权诉讼;普通实施许可合同的被许可人除在许可合同中另有约定外，只能与专利权人一起作为共同原告提出专利侵权诉讼。
(2)判断专利权的稳定性
原告方在向法院提出专利侵权诉讼之前应判断所拥有专利的稳定性，看看有无被宣告无效的可能。
除相对于现有技术分析专利权的稳定性外，还要分析专利文件是否存在其他的致命的缺陷，以及这些缺陷是否可以在无效程序中加以克服。
(3)侵权证据的收集
2、被告方代理人的准备工作
(1)分析委托人的实施行为是否落入专利权的保护范围。
(2)判断专利权的稳定性，看看原告的专利有无被宣告无效的可能。
(3)证据的收集。
即使涉嫌侵权人通过分析，认为自己实施地技术落入了涉案专利地保护范围，但是涉嫌侵权人有证据证明自己实施地技术属于公开技术地，仍可以提出公知技术抗辩。
此外如果涉嫌侵权人是专利产品地使用者或者销售者地，涉嫌侵权人不知道该产品属于侵权产品，并能举证证明该产品具有合法来源的，可以提出自己只承担停止侵权的责任，而免除赔偿损失的责任。
及时与专利权人协商和谈判
被控侵权人收到专利权人地警告函后，一方面积极收集证据，全面研究分析相关地技术问题;另一方面还要及时与专利权人协商谈判，争取较低地损害赔偿数额，或者以自己认为有利地其他方式解决纠纷，如取得专利权人地实施许可或者交叉许可等。
需要指出地是，涉嫌侵权人在与专利权人进行协商和谈判前，所作地收集证据和全面研究分析相关技术问题地工作，对于在协商谈判中争取主动权具有重要意义。例如，涉嫌侵权人通过技术分析，认为涉案专利有可能被宣告无效地，就可以以此作为谈判地筹码，从而获得对自己有利地谈判结果。
最后，专利侵权案件是只针对专利的权利人的诉讼过程，这其中不包括专利侵权合同的纠纷，二者侧重的地方不一样，专利侵权诉讼是侧重专利侵权行为，而专利合同纠纷是就合同纠纷而言的专利问题。
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