每个地区法院指定的笔迹鉴定机构不一样。法院会和专门的司法鉴定所进行合作。一般来说都是去公安机关的刑事鉴定中心进行相关鉴定。但是也有其他的法院会跟当地的一些民办司法鉴定所进行合作。
法院指定的笔迹鉴定机构在哪里?
申请笔迹鉴定去市级及以上的公安机关的刑事鉴定中心，从事笔迹司法鉴定所进行鉴定。
笔迹鉴定条件：
1、一般要求委托人提供检材原件，有的案件调取原件有困难的，可以由鉴定机构派人现场拍照或由出处者签章提供复印件。
笔迹鉴定要求：
1、需要有检材，文书司法鉴定中的检材，是指对文件中的某项内容(如：笔迹、印章、打印文件)有异议需要鉴定的材料，称为检材。
2、需要样本，是指与检材相对应的供检验比对的材料。如：书写人同年或相近年份、年代的真实笔迹样本若干份，对数量没有具体要求，一般3-5份左右，只要特征反映充分就可以作为样本比对材料。
根据笔迹不同分类可以看出，虽然这两种分类有一定的差异，但是，这些分类基本上都反映了笔迹的基本特征，只是从笔迹鉴定角度进行的分类显得更全面一些。而从笔迹分析的角度进行的分类，更体现出笔迹心理分析的需要。
而在两大分类角度的具体分类上也有一定的差异。比如韩进先生和刘兆钟先生的分类，差异还是比较明显的。综观不同的分类，虽然看上去各有特点，五花八门，但是，就笔迹的基本特征来看，都被包含其中了，只是在细分的角度有一些不同的划分和侧重点不同。
对笔迹鉴定的申请由谁提出，当原告所提供证据达到了证明借贷关系成立或证明了借条系被告所书，完成了举证责任时，被告如否认是其签字则由被告申请作笔迹鉴定;对“谁主张、谁举证”原则的正确理解。
《刑事诉讼法》第七十六条 鉴定程序启动方式
当事人可以就查明事实的专门性问题向人民法院申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人;协商不成的，由人民法院指定。当事人未申请鉴定，人民法院对专门性问题认为需要鉴定的，应当委托具备资格的鉴定人进行鉴定。
第七十七条 鉴定人权利及鉴定意见形式
鉴定人有权了解进行鉴定所需要的案件材料，必要时可以询问当事人、证人。鉴定人应当提出书面鉴定意见，在鉴定书上签名或者盖章。
第七十八条 鉴定人出庭作证制度
当事人对鉴定意见有异议或者人民法院认为鉴定人有必要出庭的，鉴定人应当出庭作证。经人民法院通知，鉴定人拒不出庭作证的，鉴定意见不得作为认定事实的根据;支付鉴定费用的当事人可以要求返还鉴定费用。
第七十九条 申请有专门知识的人出庭制度
当事人可以申请人民法院通知有专门知识的人出庭，就鉴定人作出的鉴定意见或者专业问题提出意见。
一般来说，如果要用笔记鉴定来作为证据的话，需要向法院提出相关申请，如果是个人私自做出的笔迹鉴定，在法律上是不具备法律效力的。一般来说，法院会指定相关的司法鉴定机构来让被告或者原告进行司法鉴定。如果认为法院指定的司法鉴定机构有问题的话，可以向法院提出要求更换机构进行检验。
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