商标权和软件著作权的保护对象不同，保护的范围不同，原始权利的取得方式不同，适用的法律规定不同，保护的目的不同，管理的机构也有所不同，商标权需要申请才能获得，著作权在作品完成之后就享有。
一、商标跟软件著作权的区别有什么?
(1)保护的对象和范围不同
著作权的对象是作者所创的文学、艺术和科学作品，是有形资产。其作品包括以下形式：文学作品;口述作品;音乐、戏剧、曲艺、舞蹈作品;美术、摄影作品;工程设计、产品设计图纸及其说明;地图、示意图等图形作品;计算机软件;法律、行政法规规定的其他作品。对著作权的保护范围是指这些作品的发表权，修改权，保护作品完整权，使用权和获得报酬权。
而商标权的对象是以文字，图形或者其组合构成的注册商标，属无形资产。对商标权的保护范围以核准注册的商标核定使用的商品为限。
(2)原始权利产生的途径不同
著作权在我国同其他大多数国家一样，都是在作者的作品创作完成之后，即依法自动产生，而不需要经过任何主管机关的审查批准。而商标权在我国实行的是注册在先原则，只有经过最先申请注册并获主管机关的审查核准后，才能取得商标专用权。
(3)国家主管机关和适用法律不同
我国《著作权法》是管理著作权的基本法律。国家版权局是主管全国著作权的管理工作。
(4)保护的目的不同
著作权保护的是在文学，艺术和科学方面所创作的作品和与此相关的权益。其目的在于鼓励有益于社会的作品创作和传播，促进社会文化和科学事业的发展和繁荣。
商标权保护的商标，是具有区别商品或服务来源的显著特征的标志。保护的目的是为了促进生产者保证商品质量和维护商标信誉，以保障消费者的利益，促进社会商品经济的发展和公平竞争。
二、软件著作权的限制是什么?
对于著作权人的权利，法律上通常予以一定限制，以平衡著作权人的局部利益与社会的整体利益。对软件著作权的限制主要是：
1、时间限制：软件开发者的开发者身份权保护期不受限制。软件著作权的其他权利保护期为25年，截止于软件首次发表后第25年的12月31日，保护期满前，软件著作权人可以向软件登记机构申请续展25年，但保护期最长不超过50年。因继承或单位分立、合并等法律行为使著作权人主体发生合法变更时，不改变相应软件著作权的保护期。因依法签订使用权或使用权许可合同而转让有关权利时，转让活动的发生不改变有关软件著作权的保护期。当拥有软件著作权的单位终止或拥有软件著作权的公民死亡而无合法继承者时，除开发者身份权外，有关软件的其他各项权利在保护期满之前进入公有领域。
2、在保护期内，因课堂教学、科学研究、国家机构执行公务等非商业性目的的需要对软件进行少量复制，可以不经软件著作权人同意，不向其支付报酬。
3、软件著作权人不得损害公众利益，违反其他法律。
4、软件复制品合法持有人，在不经该软件著作权人同意的情况下，可以根据使用的需要把该软件装入计算机内，制作备份复制品，进行必要的修改等。
这两种权利的法律概念不同，软件著作权有时间的限制，软件著作权中的身份权不受保护期限的限制，但是财产权保护期是25年，从软件发表之日开始计算，软件著作权人依法享有著作权，不能损害公共利益，不能违反法律规定。
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